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Científicos argentinos desarrollan un test que detecta el coronavirus con o sin síntomas

Posted on 14 junio 2020 by hj

Investigadores de UNSAM y UNQ crearon un test que permite diagnosticar a personas con coronavirus, tengan síntomas o no.

Investigadores de las Universidades de San Martín y de Quilmes, junto a dos Pymes tecnológicas desarrollaron un kit que permite diagnosticar a personas que están cursando la infección de coronavirus, tengan síntomas o no. Es más rápido y tiene mejor sensibilidad que el test RT-PCR. Utiliza componentes y tecnología argentina y fue aprobado por la ANMAT. Podrían producir 100 mil kits por mes.

Según aclararon, el test ELA-CHEMSTRIP diagnostica a personas que están cursando la enfermedad, ya sea que presenten síntomas de coronavirus o no. Si el test da negativo significa que la persona o bien no estuvo expuesta al Covid-19, o bien que ya se recuperó.

Para saber si una persona que no presenta síntomas se recuperó del Covi-19 hay que utilizar otro tipo de test, denominado serológico, que miden la presencia de anticuerpos en sangre. ELA-CHEMSTRIP, en cambio, mide la presencia del virus en células de la nariz y la faringe

Coronavirus en Argentina: el kit funciona en tres pasos a partir del hisopado nasofaríngeo de la persona a diagnosticar

El kit funciona en tres pasos a partir del hisopado nasofaríngeo de la persona a diagnosticar. Todo el proceso dura una hora y media y puede realizarse con los productos que vienen en el kit diagnóstico, más un equipo para incubar a 60°. Es decir que no requiere el equipamiento costoso y sofisticado que utilizan los test moleculares RT-PCR.

Se pasa un hisopo por la nariz del paciente y se obtienen sus células. Después se procesan esas células para que liberen el ARN del virus si estaban infectadas”, explicó Diego Comerci, investigador del Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIB) de la UNSAM y coordinador del desarrollo

El siguiente paso es garantizar que el virus sea detectable, por lo que se aplica la tecnología ELA (Easy Loop Amplification), para amplificar su presencia, por más mínima que sea. El diagnóstico concluye con una tira que, al entrar en contacto con el ARN viral amplificado, reacciona mostrando dos bandas coloreadasSi el virus no estaba presente, la tira muestra una sola banda y significa que el paciente no está infectado”, detalló.

Cómo funciona el nuevo Test ELA-CHEMSTRIP de Covid-19

1) Hisopado y extracción del ARN del virus: se toma una muestra de células de la nariz y la faringe de la persona a diagnosticar con un hisopo. Se procesa la muestra en un tubo con soluciones y resinas para que si hay células infectadas con Covid-19, liberen el ARN viral.

2) Amplificación del ARN viral: Al tubo con la solución del paso anterior se le incorpora un complejo enzimático y se lo incuba a 60° durante 45 minutos. Esta tecnología se llama ELA y su función es amplificar exponencialmente el ARN del virus, para que pueda ser detectado en el siguiente paso.

3) Diagnóstico con tira reactiva: Se incorpora una tira reactiva a la solución ya amplificada. Si después de 10 minutos muestra dos bandas coloreadas, significa que la persona tiene el virus Covid-19. Si muestra una sola banda coloreada, significa que no lo tiene.

El test ELA-CHEMSTRIP ya fue aprobado por ANMAT. Fue diseñado para detectar moléculas del virus SARS-Cov-2, por lo que permite diagnosticar a personas que están cursando la infección, tengan síntomas o no, con la máxima performance diagnóstica. En este sentido, uno de los investigadores de la UNQ, Daniel Ghiringhelli señaló que “la sensibilidad de nuestro método es impresionante y podría complementar el trabajo que ya se está haciendo con otros tests, en la medida en que abriría la puerta al testeo de una mayor cantidad de casos”.

“El objetivo era garantizar la soberanía sanitaria sobre los diagnósticos de Covid-19. Para eso teníamos que desarrollar un kit con los mejores estándares de calidad y producir localmente todos los insumos necesarios”, contó Comerci. “Como el test que desarrollamos da el resultado casi cuatro veces más rápido que los test RT-PCR y permite descentralizar aún más los testeos, ofrece la posibilidad de incrementar la cantidad de diagnósticos por día y quizás contribuir al levantamiento gradual del aislamiento obligatorio. También significa un ahorro de dólares y un ejemplo de lo que podemos hacer los argentinos y las argentinas con un Estado presente y coordinado”, celebró.

Desde el punto de vista productivo, cada uno de los tres pasos del kit diagnóstico implica un producto diferente. “Los pasos 1 y 3 tienen algunos insumos importadospero en conjunto el kit tiene un 80% de componentes nacionales. Que la producción sea 100% nacional es posible porque además de investigadores somos socios fundadores de pymes tecnológicas”, sostuvo Andrés Ciocchini, investigador del IIB de la UNSAM.

El desarrollo contó con financiamiento específico de la Secretaría de Asuntos Estratégicos de Presidencia de la Nación, del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación, y de la Agencia I+D+i.

Empezamos con la parte técnica el 15 de marzo. Llevamos dos meses trabajando 12 horas por día promedio, fines de semana incluido. Estamos cansados, pero contentos porque esperamos que esto nos ayude a todos y todas”, contó Marcos Bilen, investigador de la UNQ y socio fundador de la pyme tecnológica PB-L.

“Además de las áreas que nos financiaron, nos apoyaron la UNSAM y la UNQ, el Ministerio de Salud y el Instituto ANLIS Malbrán. Inclusive se involucraron Cancillería y Aerolíneas Argentinas, para repatriar a tres integrantes del equipo de PB-L que estaban en el exterior al momento de decretarse el aislamiento social preventivo y obligatorio. El apoyo estatal también fue clave para poder importar insumos con urgencia: el Ministerio de Ciencia logró poner en funcionamiento el ROECyT, un procedimiento que había dejado de funcionar en los últimos meses de la gestión anterior. En dos semanas ejecutaron más de 30 solicitudes. Aerolíneas Argentinas nos trajo insumos desde China. También colaboraron la Aduana, la AFIP, la ANMAT y el SENASA. Es impresionante”, aseguró Comerci.

Las pymes que colaboraron son CHEMTEST, incubada en la Fundación Argentina de Nanotecnología (FAN) del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación dentro del Campus de la UNSAM; y Productos Bio-Lógicos (PB-L), una empresa de base tecnológica creada desde la UNQ. En conjunto están en condiciones de producir 100.000 kits diagnósticos de Covid-19 por mes.

El equipo de investigadores que lideró el desarrollo está integrado por Diego Comerci, Juan Ugalde y Andrés Ciocchini, todos investigadores del CONICET en el IIB de la UNSAM, donde se doctoraron y se desempeñan como docentes. El equipo de investigadores de la UNQ, por su parte, está liderado por Marcos Bilen, Daniel Ghiringhelli, Cristina Borio y Ana Ventura. Además, participaron una decena de investigadores y técnicos de las pymes de base tecnológica. Por UNSAM y CHEMTEST participaron Luciano Melli, Josefina Caillava, Analía Novak, Stella Maris Landívar, Tamara Laube y Agustina Carreño. Por PB-L, Vanina Rodriguez, Cristian Mobilia, Marcelo Romero y Melisa Da Silva.

Fuente: Minuto Uno

https://www.minutouno.com/notas/5109719-cientificos-argentinos-desarrollan-un-test-que-detecta-el-coronavirus-o-sintomas?fbclid=IwAR0wf7bMrRR8-UXnfI1g5EDNE2bN2xogW2ObmPA5t-KNG95NFpVJoKtt5QY?fbclid=IwAR0wf7bMrRR8-UXnfI1g5EDNE2bN2xogW2ObmPA5t-KNG95NFpVJoKtt5QY

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Nuevo microscopio detecta el coronavirus al instante y lo creó un joven argentino

Posted on 11 junio 2020 by hj

Luis Alfredo Ragone es licenciado en Criminalística y es uno de los principales creadores de un microscopio que detecta partículas fluorescentes y permitirá detectar la portación de COVID-19 en pacientes sospechosos.

Por Emi Alonso

Un increíble avance para la medicina fue motivado por un joven licenciado en Criminalística que encabezó al equipo creador de un microscopio digital portátil de inmunofluorescencia, uno de los pocos en su tipo en Argentina, que detectaría de forma rápida, precisa y a menor costo, pacientes con portación del virus causante del COVID 19.

Actualmente, la prueba por PCR a tiempo realpresentan muchas limitaciones como tiempos de respuesta largos, requerimiento de laboratorios certificados, equipo costoso y técnicos capacitados para realizarlos, sumado a la gran cantidad considerable de falsos negativos para el COVID-19.

Sin embargo, la técnica de la inmunofluorescencia que utilizará el microscopio digital creado por Alfredo Ragone, es uno de los procesos por excelencia dentro del campo de análisis, por su gran sensibilidad y especificidad para evidenciar la presencia o ausencia de virus, a través de la observación de partículas fluorescentes en muestras marcadas con anticuerpos específicos.

El microscopio creado por el entrerriano estará compuesto por una cámara de video de alta resolución encargada de transmitir imágenes en tiempo real a través del software de captura, permitiendo al operador evidenciar la presencia de virus a través de la observación de partículas fluorescentes en muestras marcadas con anticuerpos específicos.

Este punto no resulta menor ya que, además de la mayor especificidad y sensibilidad y el menor costo que propone esta tecnología, el poder realizar un análisis directo a través de un monitor o pantalla sin necesidad de oculares ópticos también permitirá que un grupo de profesionales completo pueda acceder a la muestra.

El Malbrán logró desarrollar por primera vez a nivel nacional y regional, un ensayo de inmunofluorescencia que permite la detección del SARS-CoV-2 eje fundamental para dar inicio al desarrollo nacional de un «test de diagnóstico de anticuerpos», test y estudio que es perfectamente complementario y le da la especificidad adecuada al microscopio creado en Concordia, para poder detectar coronavirus.

Fuente: Que pasa Salta

https://www.quepasasalta.com.ar/nota/236649-nuevo-microscopio-detecta-el-coronavirus-al-instante-y-lo-creo-un-joven-argentino/

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Científicas tucumanas crean el primer test local para detectar hepatitis E

Posted on 09 junio 2020 by hj

Este desarrollo permitirá el diagnóstico en Tucumán y en Argentina con un costo entre 10 y 15 veces menor al único test que se utiliza en la actualidad, que es importado de Italia.

El trabajo de las profesionales tucumanas fue publicado recientemente en la revista científica Frontiers in Microbiology. Foto de Medios UNT.

Un conjunto de científicas tucumanas desarrollaron el primer test serológico local para detectar el virus de la hepatitis E (VHE). En Argentina la única prueba disponible es una desarrollada en Italia. El test local es de tipo ELISA, utiliza insumos nacionales y está desarrollado a partir de una proteína del virus, expresada en la bacteria Escherichia coli.
La hepatitis E es una enfermedad emergente, de la que cada vez se conocen más casos y recién en los últimos años se empezaron a realizar los estudios epidemiológicos para detectarla. Se trata de una enfermedad hepática que puede provocar dolor abdominal, anorexia, náuseas, vómitos y fiebre. Los test serológicos detectan los anticuerpos presentes en el plasma de pacientes que se enfrentaron a una enfermedad, en este caso al VHE. 
Según detalla el sitio oficial de la Universidad Nacional de Tucumán, el test en cuestión, se desarrolló en el Laboratorio Central de Ciencias Básicas de la Facultad de Medicina y en el Instituto Superior de Investigaciones Biológicas (Universidad Nacional de Tucumán- Conicet) y fue validado con estándares internacionales. El equipo está formado por Guadalupe Vizoso Pinto (directora de la investigación), Lorena Arce (que acaba de doctorarse con el tema), Melisa Müller y las doctoras Felicitas Agote y Gabriela Marranzino, ambas del Siprosa. El trabajo fue publicado recientemente en la revista científica Frontiers in Microbiology.
La Organización Mundial de la Salud calcula que cada año hay unos 20 millones de casos de infección por este virus. La enfermedad puede ser asintomática (la mayoría de las veces), aguda o crónica y produce alta mortalidad en el tercer trimestre de embarazo. En la mayoría de los laboratorios de los países occidentales el test de hepatitis E no está disponible y se sospecha ante un cuadro clínico compatible con test negativos para hepatitis A, B y C.Vizoso Pinto, doctora en Ciencias Biológicas, señaló que es el primer test para hepatitis E producido en Argentina y que tiene altos niveles de especificidad (99%) y de sensibilidad (93%), cuando se lo compara con el test comercial disponible en el país. Detalló que el antígeno que usaron para el test es la proteína ORF2 que forma parte del virus de la hepatitis E. “Una de las principales diferencias con otros test es que al nuestro lo produjimos en base a una proteína que se puede expresar innumerable cantidad de veces en una bacteria (Escherichia coli), lo cual abarata los costos de producción”.

Augusto Bellomio, investigador del Conicet y doctor en Ciencias Biológicas, que no formó parte de la investigación, opinó sobre el trabajo. “Este desarrollo es muy importante porque permitirá el diagnostico en Tucumán y en Argentina que tienen como único test uno importado. Este costaría entre 10 y 15 veces menos”. Agregó que realizar estudios de VHE permitiría evaluar la sangre de donantes y realizar estudios epidemiológicos, de tipificación y de diagnóstico”.

Alto porcentaje de tucumanos con hepatitisE
El estudio incluyó el análisis de 813 muestras de suero del Banco de Sangre de Tucumán recolectadas en 2017. La edad media de los donantes fue de 35 y la mayoría de los participantes fueron hombres (73%).La mitad de las muestras fueron de San Miguel de Tucumán y el resto de Trancas, Ralos, Cruz Alta, Bella Vista, Leales y Tafi Viejo. El 9.23% de las muestras analizadas resultó positivo para anticuerpos contra el virus de la hepatitis E, lo cual quiere decir que 9 de cada 100 personas tuvieron hepatitis E a lo largo de su vida.
Vizoso Pinto manifestó que el estudio epidemiológico les permitió demostrar que el virus de la hepatitis E circula en Tucumán y que la seroprevalencia fue superior al 9%. “Es muy importante conocer que este patógeno está presente en nuestra provincia y que contamos con una herramienta de diagnóstico local que permite evaluar de forma precisa la enfermedad”, señaló.

La hepatóloga del Hospital Padilla, Daniela Pérez, argumentó que contar con un test rápido y efectivo al alcance -como el desarrollado por las investigadoras tucumanas- “resulta de mucha utilidad y nos va a permitir conocer que pasa realmente en nuestra población. La hepatitis E es una enfermedad de la que hasta hace poco no se conocía mucho y a nivel mundial toma cada vez mayor interés y se estudia cada vez más”, opinó la profesional.

Fuente: El Tucumano

https://www.eltucumano.com/noticia/actualidad/264217/cientificas-tucumanas-crean-el-primer-test-local-para-detectar-hepatitis-e?dnd=rss&fbclid=IwAR22eTqEPwUAXEd-Ov6eQZab9B6ohMBQjmCkapDlu7JZL8PtsB3Z1PY4xqY

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La Plata: Investigadores desarrollan un dispositivo para detectar coronavirus en menos de cinco minutos

Posted on 29 mayo 2020 by hj

El aparato es portátil y permite la detección “sin la necesidad de uso de reactivos químicos”. En el proyecto trabaja un grupo de investigadores de la Universidad Nacional de La Plata (UNLP)

Un grupo de investigadores de la Universidad Nacional de La Plata (UNLP) desarrolla un dispositivo que permitirá detectar en pocos minutos la presencia del virus Sars-Cov2, causante del coronavirus, en muestras de hisopados nasales o nasofaríngeos.

Se trata de un dispositivo de medición portátil para la detección de biomoléculas de interés clínico con sensores de nanomateriales, que -según consignó la universidad- permite realizar la detección “sin la necesidad de uso de reactivos químicos, y sus resultados se obtendrán en menos de cinco minutos”.

“El test tendrá una enorme ventaja por sobre los métodos de detección existentes, dado que, al no requerir un proceso complejo de purificación de las muestras, ni cámaras de bioseguridad, los análisis podrán realizarse en cualquier lugar, incluyendo la vía pública, estaciones de trenes o aeropuertos”, precisaron los responsables del proyecto.

Desde la casa de estudios remarcaron que el desarrollo “permitirá el ‘screening’ de pacientes asintomáticos, con resultados en tiempo real, garantizando que, aun cuando las medidas de aislamiento sean flexibilizadas, se podrá rastrear casos, y contener segundas o terceras olas de contagio”.

El biosensor será elaborado por Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas INIFTA (Unlp-Conicet) de la Facultad de Ciencias Exactas.

La Universidad Nacional de La Plata aportará el trabajo de sus investigadores, las instalaciones y equipamiento para contribuir al desarrollo del dispositivo, centrándose en la ingeniería de nanotecnología y biotecnología necesarias para fabricar el biosensor.

En tanto, la compañía Gisens Biotech sumará sus recursos humanos, instalaciones y equipamiento para el desarrollo de la ingeniería electrónica, y software, necesarios para terminar de formar el dispositivo medico portátil (Télam).

Fuente: Noticias La Insuperable

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Coronavirus : presentan en Argentina un ensayo clínico local de tratamiento antiviral contra COVID-19

Posted on 15 mayo 2020 by hj

El estudio del bioquímico argentino Daniel Katzman se basa en dar virus atenuados que no se replican ni provocan la enfermedad y buscan generar una respuesta antiviral

Se trata de un ensayo clínico de tratamiento por superinfección que se basa en dar virus atenuados que no se replican ni provocan enfermedad, muy inmunogénicos y que generan una gran respuesta antiviral (REUTERS)

Desde la aparición de primeros casos de coronavirus en diciembre de 2019, pasando por la declaración de pandemia de la Organización Mundial de la Salud (OMS) hasta superar ampliamente la barrera del millón de infectados, el nuevo SARS-CoV-2 puso en jaque al sistema sanitario global.

Daniel Katzman, bioquímico, graduado en la Universidad Nacional de La Plata, que cuenta con más de 20 años de experiencia en biotecnología y desarrollo de fármacos, es fundador y CEO de la empresa Unleash Immuno Oncolytics (Saint Louis, Missouri, USA) que desarrolla productos oncolíticos para inmunoterapia. Se trata de uno de los científicos que está trabajando hoy desde la Argentina en la investigación de un tratamiento eficaz contra el SARS-CoV-2.

El tratamiento podría cambiar el resultado de la enfermedad y complementar otros enfoques terapéuticos y del desarrollo de vacunas (REUTERS)

Katzman trabaja en un ensayo clínico de tratamiento por superinfección que se basa en dar virus atenuados que no se replican ni provocan la enfermedad en el organismo. Son muy inmunogénicos y generan una gran respuesta antiviral en pacientes con sintomatología leve. El sistema inmune los reconoce y genera una respuesta antiviral fuerte que puede servir para atacar otras infecciones.

“Es un antiviral, que actúa induciendo al organismo a la producción endógena de interferón tipo I, el cual es efectivo para disminuir la carga viral. El paciente se beneficia de la superinfección con un virus dsRNA apatogénico como el patógeno de la enfermedad de la bursitis infecciosa (IBDV), que es un poderoso activador del programa de genes antivirales dependientes de interferón», indicó a Infobae el especialista.

Los interferones son un grupo de proteínas señalizadoras producidas y secretadas por las células como respuesta a la presencia de diversos patógenos tales como virus, bacterias o parásitos que generan una activación en las defensas antivirales en las células cercanas.

El tratamiento ha sido probado en seres humanos para hepatitis B y C, con resultados positivos y en pruebas de laboratorio se ha demostrado su actividad contra el SARS-CoV-2 (REUTERS)

Este tratamiento ha sido probado en seres humanos para hepatitis B y C, con resultados positivos y en test de laboratorio se ha demostrado su actividad contra el SARS-CoV-2. “Estamos ante la posibilidad de que la Argentina le ponga un freno a la pandemia”, aseguró Katzman.

El especialista entiende que es posible avanzar en el uso compasivo del medicamento, un procedimiento restringido a casos excepcionales, pero cada vez más utilizado para el tratamiento de determinadas enfermedades para las que no hay un tratamiento alternativo eficaz, tal el caso de COVID-19.

Consultado sobre la efectividad y el impacto que podría tener el mecanismo por superinfección en caso de ser aprobado y puesto a prueba, el experto sostuvo que “es -de todos los probados hasta ahora- el que tiene la mejor relación riesgo-beneficio, ya que según lo demostrado, es el que tiene más chances de tener éxito y el que menos contraindicaciones tiene frente a los otros caminos que se han tomado».

“No le hemos encontrado contraindicaciones significativas ni importantes, ni efectos secundarios en toda la etapa de pruebas, y eso es central para la solución y los pacientes», concluyó.

Fuente: Infobae

https://www.infobae.com/salud/ciencia/2020/04/12/coronavirus-en-argentina-presentan-un-ensayo-clinico-local-de-tratamiento-antiviral-contra-covid-19/

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Coronavirus: un grupo de investigadores argentinos desarrolló un programa que detecta casos positivos en 3 minutos

Posted on 12 abril 2020 by hj

Foto: Tiempo de San Juan

Se hace a través de una radiografía de tórax y un software. Es efectiva entre un 95% y 98%. Es gratuito y no reemplaza al test PCR.

Un grupo de investigadores argentinos desarrolló un sistema gratuito que identifica casos positivos de coronavirus en apenas 3 minutos y con una precisión de entre un 95% y 98%. Se trata de un software que trabaja a través de un diagnóstico por imagen de una radiografía de tórax en conjunto con una inteligencia artificial específica. No reemplaza al test PCR.

El programa se llama Covid X y fue desarrollado por un equipo de 7 estudiantes de la UADE, la Universidad Nacional de San Juan y el ITBA.

“Estamos entusiasmados, creemos que esta herramienta tiene la posibilidad de ayudar al cuerpo médico sin necesidad de grandes inversiones”, cuenta el director del proyecto a Clarín, Santiago Bassani, que cursa ingeniería informática  en el ITBA y es encargado del desarrollo del proyecto.

El sistema usa estudios hechos con tomografía computada (TC) y rayos X (radiografías) como fuente para ser analizado en un sistema. Eso se introduce en un “modelo preentrenado” (una inteligencia artificial que llamaron VGG16) que da como resultado si el paciente es positivo o negativo en coronavirus.

La idea la trabajaron a partir de una serie de trabajos científicos publicados por la sociedad radiológica de Estados Unidos (RSNA) por médicos de Wuhan, China, ciudad de donde salió el coronavirus, junto a una gran cantidad de papers relacionados al uso de inteligencia artificial y la detección temprana de Covid-19.

“Utilizando las arquitecturas ya planteadas entrenamos un modelo preliminar y lo testeamos con a 200 radiografías (100 sanas y 100 infectadas): frente a los resultados prometedores, comenzamos a contactar médicos interesados en el proyecto”, explica Bassani.

Y hasta el momento, según detallan desde el proyecto, los resultados son “prometedores”, aunque saben que se necesita una prueba más extensa con más datos para llegar a una conclusión definitiva. Esto es, necesitan más imágenes para poder determinarlo.

Bassani es claro respecto del tipo de prueba que se trabaja: no reemplaza al PCR, el examen más extendido en la actualidad para detectar casos de Covid-19. «Bajo ningún punto de vista reemplaza a un test PCR. El uso de radiografías y tomografías computarizadas apela a ser una alternativa para los denominados test rápidos«, explica. 

Pero también advierte de la utilidad de estos métodos: «Dado los resultados experimentales que obtuvimos hasta el momento y basados en medidas que tomaron otros países, vemos que hay lugar para el uso de estas técnicas».

Cómo funciona

El sistema trabaja con placas de tórax que pueden obtenerse mediante rayos X o una tomografía computada, ambos estudios disponibles de manera extendida en los sistemas de salud mundiales. Esto se introduce en una base de datos que se está generando con información de enfermedades conocidas y con las características del Covid-19. Por eso se sirve del concepto de big data: cuanta más información tenga, mejor funciona.

Esto está puesto a trabajar en conjunto con una inteligencia artificial (AI, por su sigla en inglés): “La inteligencia artificial que utilizamos se denomina red neuronal convolucional. Se trata de una arquitectura en la que presentamos una imagen y el modelo permite extrapolar de dicha imagen las características que aprende. En nuestro caso, el modelo detecta patrones cristalinos que se forman dentro de los pulmones. Actualmente, el modelo solo nos devuelve la probabilidad de estar infectado o no”, explica el estudiante.

Bajo ningún punto de vista reemplaza a un test PCR: apela a ser una alternativa

Santiago Bassani (ITBA), encargado del proyecto
Parte del equipo de desarrollo de la app argentina para detectar coronavirus: Santiago Bassani, Florencia Gatti y Leonardo Sánchez (de izquierda a derecha)

Parte del equipo de desarrollo de la app argentina para detectar coronavirus: Santiago Bassani, Florencia Gatti y Leonardo Sánchez (de izquierda a derecha)

“Nuestros esfuerzos se encuentran en dos lugares. Por un lado, darle mayor interpretabilidad a los resultados. Esto significa que el modelo devuelva la imagen original con los contornos donde, sospecha, hay posibles rasgos distintivos de Covid-19. Esto permitiría al profesional a cargo, tomar una mejor decisión y más informada”, sigue Bassani.

Todo el proceso toma apenas 3 minutos y se realiza desde una página web.

También, Bassani explicó que el proyecto apunta a “ampliar la clasificación para poder detectar otras enfermedades y así, ayudar en un manejo más rápido de casos que parezcan covid-19 pero no lo sean”.

Un ejemplo de cómo se ve el programa.

Un ejemplo de cómo se ve el programa.

Una precisión del 95%

Un tórax típico compatible con neumonía de Covid-19. (RSNA)

Un tórax típico compatible con neumonía de Covid-19. (RSNA)

Según explicó Bassani a Clarín, el 95% de precisión que tienen estos trabajos “representa el porcentaje de verdaderos positivos y verdaderos negativos que el clasificador logra detectar sobre el total de casos que miró”.

La métrica se obtiene a partir de una clasificación de 200 imágenes con un modelo ya entrenado, y luego se suman los casos donde se clasificó correctamente (positivo o negativo) y finalmente se divide por el total de casos, 200. “Para que dicho test tenga una significancia estadística, se corre el mismo test con varios conjuntos de datos distintos (variando el orden de las imágenes): eso da cerca de 95%”, explica.

Estamos muy entusiasmados: se puede ayudar a los médicos sin grandes inversiones

El desafío: evitar el falso negativo

Covid-X: el programa que desarrollaron argentinos para detectar casos de coronavirus a partir de radiografías.

Covid-X: el programa que desarrollaron argentinos para detectar casos de coronavirus a partir de radiografías.

Hay dos cuestiones que son muy importantes en el proyecto. Por un lado, lo que llaman “sensibilidad del modelo: el porcentaje de verdaderos positivos sobre el total de casos positivos. “En criollo, quiere decir ‘la proporción de enfermos correctamente identificados’ y esto es sumamente útil para determinar que no se produzcan muchos falsos negativos”, explica Bassani.

Y para evitar errores, también está la medida “especificada”. “Dicha medida nos indica el porcentaje de casos correctamente identificados como negativos. Ayuda a determinar si el modelo no clasifica muchas imágenes como infectadas cuando realmente no lo están”, aclara.

El equipo de trabajo y en qué estado está el proyecto


El instituto Malbrán, donde se testean casos de coronavirus. (Clarín)

El instituto Malbrán, donde se testean casos de coronavirus. (Clarín)

Son siete investigadores en total las que conforman el proyecto, que de hecho se presentaron a un concurso para darlo a publicidad. Martín Infesta, jefe del departamento técnico de radiodiagnóstico del Hospital Gutiérrez, es la “pata radiológica”. Bassani, como se explicó, es el encargado del diseño de la inteligencia artificial y el desarrollo general. “Las puertas están siempre abiertas a quienes quieran sumarse al proyecto”, aclara.

Florencia Gatti (UADE) y Manuel Ponieman se encargan de la difusión y Gabriel Salcedo (UNSJ), Miguel Mavo (UNEFA) y Leonardo Sánchez en el desarrollo de la plataforma web.

A la página, por supuesto, se puede acceder desde cualquier computadora o dispositivo móvil. El software podría ser una pieza clave en la detección de casos para los servicios de salud.

Se puede acceder, acá: https://cov-x.com/

Fuente: Clarin

https://www.clarin.com/tecnologia/coronavirus-grupo-investigadores-argentinos-desarrollo-programa-detecta-casos-positivos-3-minutos_0_ex-j83SgW.html

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